3988元全包包含第二年的年审费用吗？

不包含。¥3,988元为香港公司首年注册及首年法定秘书服务的全包价。第二年的年审费用（含政府规费及代理服务费）需根据公司实际运营情况在到期前另行缴纳，通常在3000-4500元人民币左右。